Le comte Renaud de
Bavans était propriétaire du fief du Magny (dépendance
de la terre d'Etobon) depuis 1304, date à laquelle il l'acquit de Richard,
dit Banegnard, connétable de Bourgogne.
La version la plus citée est ensuite celle qui indique que l'ancienne
seigneurie du Magny-Danigon (qui incluait aussi Couthenans et une partie de
Clairegoutte) fut perdue par les héritiers de Renaud (alliés aux
Barons comtois) lors du conflit qui les opposait à Eudes IV, duc de Bourgogne.
Eudes IV confia ses acquisitions
à Hugues de Bourgogne et les fit par la suite entrer dans ce qu'on
nomma la "Terre d'Etobon d'Hugues de Bourgogne".
Hugues de Bourgogne
décida dès lors de faire construire un château au Magny-
Danigon, afin de mieux défendre Etobon et la seigneurie de Lure dont
il était gardien.
Le sort du fief du Magny
suivra désormais le tracé historique suivant:
* 1349: Le fief est rendu
par les héritiers d'Eudes IV aux deux filles du comte Renaud de Bavans.
* 1374: Le Magny passe
aux mains de Jacques de Franquemont (mort en 1482), descendant de la famille
de Bavans.
* 1419: Dénombrement
dans lequel on relève l'existence du château.
* 1537: Il fait désormais
partie du fief de la seigneurie souveraine d'Etobon, sous la gouverne du duc
de Würtemberg, comte de Montbéliard.
* 1565: Installation du
premier maître d'école: Philippe Mairot.
* 1580: Jean Ulrich de
Steinek vend son fief à son suzerain Frédéric de Würtemberg:
la seigneurie d'Etobon compte donc 4 villages (Magny-Danigon, Clairegoutte,
Belverne et Etobon).
En effet, avant
1580, Belverne, Etobon et une partie de Clairegoutte formaient l'ancienne
seigneurie d'Etobon. Celle là même que la comtesse Henriette
avait affranchit de la "mainmorte" dès 1431.
* 1583: Le 4
Novembre, Frédéric décide d'affranchir de la mainmorte
les habitants du Magny-Danigon (et de l'autre partie de Clairegoutte). Cette
mainmorte était une servitude qui faisait des habitants une sorte de
"locataires perpétuels " vis à vis de leurs seigneur.
* 1588: Le colonel de Villevineux (protestant réfugié) est châtelain
du village.
* 1790: La dernière
tour du château est démantelée par les habitants.
Le village du Magny-Danigon
fit partie du Comté de Montbéliard jusqu'à son annexion
à la France. Il est envahit le 12 octobre 1792 par des hommes de la
garde nationale, qui obligent les habitants à planter le drapeau tricolore.
Il sera placé dans
le district de Lure le 11 octobre 1793.
Le 18 Septembre 1944,
40 jeunes des F.F.I. (Forces Françaises de l'Intérieur) tombent
sous les balles allemandes. Un Mur des Fusillés rappelle leur souvenir.
Le Magny-Danigon est titulaire
de la Croix de guerre 1939-45.